Determining S-allelic constitution and incompatibility group in some indigenous sweet cherry genotypes grown in West Serbia region
Определяне на S-алелна конституция и група за несъвместимост в някои местни генотипове череши отглеждани в Западна Сърбия
Abstract
Sweet cherry is a self-incompatible fruit species and shows a gametophytic self-incompatibility (GSI) system, which is genetically determined by a polymorphic locus (S), encoding at least two linked genes that determine the pistil and pollen phenotypes. Therefore, most sweet cherry genotypes are self-incompatible and many are cross-incompatible. The aim of this work was to identify the S-allelic constitutions and incompatibility groups in eight indigenous sweet cherry genotypes collected in orchards of individual growers in the region of Čačak, i.e. villages Jezdina (GТ-3), Prislonica (GТ-17, GТ-18, GТ-19, GТ-20 and GТ-21) and Ljubić (GТ-22 and GТ-23). The allelic constitution of S-RNase gene in each genotype was determined by polymerase chain reaction (PCR) with consensus and allele-specific primers. Eight alleles (S1, S2, S3, S4, S5, S6, S9 and S13) that generated seven S-genotypes [S1S2 (GТ-18), S1S4 (GТ-20 and GТ-22), S3S5 (GТ-3), S3S6 (GТ-21), S3S9 (GТ-17), S4S5 (GТ-23) and S4S13 ...(GТ-19)] were detected. Among the revealed alleles, S4 was the most frequent (25%), followed by S1 and S3 (18.75% to each allele). Based on the S-allelic constitution, the indigenous sweet cherry genotypes were assigned to the following incompatibility groups: I, V, VI, VII, IX, XVI and XLV. The obtained results represent crucial information on cross-compatibility of these Serbian accessions that is very important for both cherry breeders and growers.
Черешата е самостерилен овощен вид с гаметофитна система за несъвместимост (GSI), която се определя генетично от полиморфен локус (S), кодиращ поне два свързани гена, които определят фенотипите на плодника и полените. Следователно повечето генотипове на череша са самонесъвместими и много от тях са кръстосано несъвместими. Целта на настоящия труд бе да се определят S-алелните конституции и групите за несъвместимост в осем местни генотипове на череша, събрани в овощни градини на отделни производители в района на Чачак, т.е. селата Йездина (GТ-3), Прислоница (GТ-17, GТ -18, GТ-19, GТ-20 и GТ-21) и Любич (GТ-22 и GТ-23). Алелната конституция на ген S-RNase във всеки генотип се определя чрез полимеразна верижна реакция (PCR) с консенсус и специфични за алела праймери. Открити са осем алела (S1, S2, S3, S4, S5, S6, S9 и S13), които създават седем S-генотипа [S1S2 (GТ-18), S1S4 (GТ-20 и GТ-22), S3S5 (GТ-3), S3S6 (GТ-21), S3S9 (GТ-17), S4S5 (GТ-23) и S4S13 (GТ-19)]. Сред разкритите алели, S4 ...енай-често срещания (25%), следван от S1 и S3 (18.75% за всеки алел). Въз основа на S-алелните конституции, местните черешови сортове са разпределени в следните групи на несъвместимост: I, V, VI, VII, IX, XVI и XLV. Получените резултати представляват важна информация за кръстосаната съвместимост на тези сръбски образци, която е много важна както за селекционерите на череши, така и за производителите.
Keywords:
Prunus avium L. / autochthonous genotype / S-genotyping / gametophytic self-incompatibility / автохтонен генотип / S-генотип / гаметофитна самонесъвместимостSource:
Journal of Mountain Agriculture on the Balkans, 2021, 24, 6, 382-400Publisher:
- Troyan : Research Institute of Mountain Stockbreeding and Agriculture
Funding / projects:
- Ministry of Science, Technological Development and Innovation of the Republic of Serbia, institutional funding - 200215 (Fruit Research Institute, Čačak) (RS-MESTD-inst-2020-200215)
Collections
Institution/Community
Institut za voćarstvoTY - JOUR AU - Marić, Slađana AU - Radičević, Sanja AU - Milošević, Nebojša AU - Glišić, Ivana AU - Đorđević, Milena PY - 2021 UR - https://refri.institut-cacak.org/handle/123456789/830 AB - Sweet cherry is a self-incompatible fruit species and shows a gametophytic self-incompatibility (GSI) system, which is genetically determined by a polymorphic locus (S), encoding at least two linked genes that determine the pistil and pollen phenotypes. Therefore, most sweet cherry genotypes are self-incompatible and many are cross-incompatible. The aim of this work was to identify the S-allelic constitutions and incompatibility groups in eight indigenous sweet cherry genotypes collected in orchards of individual growers in the region of Čačak, i.e. villages Jezdina (GТ-3), Prislonica (GТ-17, GТ-18, GТ-19, GТ-20 and GТ-21) and Ljubić (GТ-22 and GТ-23). The allelic constitution of S-RNase gene in each genotype was determined by polymerase chain reaction (PCR) with consensus and allele-specific primers. Eight alleles (S1, S2, S3, S4, S5, S6, S9 and S13) that generated seven S-genotypes [S1S2 (GТ-18), S1S4 (GТ-20 and GТ-22), S3S5 (GТ-3), S3S6 (GТ-21), S3S9 (GТ-17), S4S5 (GТ-23) and S4S13 (GТ-19)] were detected. Among the revealed alleles, S4 was the most frequent (25%), followed by S1 and S3 (18.75% to each allele). Based on the S-allelic constitution, the indigenous sweet cherry genotypes were assigned to the following incompatibility groups: I, V, VI, VII, IX, XVI and XLV. The obtained results represent crucial information on cross-compatibility of these Serbian accessions that is very important for both cherry breeders and growers. AB - Черешата е самостерилен овощен вид с гаметофитна система за несъвместимост (GSI), която се определя генетично от полиморфен локус (S), кодиращ поне два свързани гена, които определят фенотипите на плодника и полените. Следователно повечето генотипове на череша са самонесъвместими и много от тях са кръстосано несъвместими. Целта на настоящия труд бе да се определят S-алелните конституции и групите за несъвместимост в осем местни генотипове на череша, събрани в овощни градини на отделни производители в района на Чачак, т.е. селата Йездина (GТ-3), Прислоница (GТ-17, GТ -18, GТ-19, GТ-20 и GТ-21) и Любич (GТ-22 и GТ-23). Алелната конституция на ген S-RNase във всеки генотип се определя чрез полимеразна верижна реакция (PCR) с консенсус и специфични за алела праймери. Открити са осем алела (S1, S2, S3, S4, S5, S6, S9 и S13), които създават седем S-генотипа [S1S2 (GТ-18), S1S4 (GТ-20 и GТ-22), S3S5 (GТ-3), S3S6 (GТ-21), S3S9 (GТ-17), S4S5 (GТ-23) и S4S13 (GТ-19)]. Сред разкритите алели, S4 енай-често срещания (25%), следван от S1 и S3 (18.75% за всеки алел). Въз основа на S-алелните конституции, местните черешови сортове са разпределени в следните групи на несъвместимост: I, V, VI, VII, IX, XVI и XLV. Получените резултати представляват важна информация за кръстосаната съвместимост на тези сръбски образци, която е много важна както за селекционерите на череши, така и за производителите. PB - Troyan : Research Institute of Mountain Stockbreeding and Agriculture T2 - Journal of Mountain Agriculture on the Balkans T1 - Determining S-allelic constitution and incompatibility group in some indigenous sweet cherry genotypes grown in West Serbia region T1 - Определяне на S-алелна конституция и група за несъвместимост в някои местни генотипове череши отглеждани в Западна Сърбия EP - 400 IS - 6 SP - 382 VL - 24 ER -
@article{ author = "Marić, Slađana and Radičević, Sanja and Milošević, Nebojša and Glišić, Ivana and Đorđević, Milena", year = "2021", abstract = "Sweet cherry is a self-incompatible fruit species and shows a gametophytic self-incompatibility (GSI) system, which is genetically determined by a polymorphic locus (S), encoding at least two linked genes that determine the pistil and pollen phenotypes. Therefore, most sweet cherry genotypes are self-incompatible and many are cross-incompatible. The aim of this work was to identify the S-allelic constitutions and incompatibility groups in eight indigenous sweet cherry genotypes collected in orchards of individual growers in the region of Čačak, i.e. villages Jezdina (GТ-3), Prislonica (GТ-17, GТ-18, GТ-19, GТ-20 and GТ-21) and Ljubić (GТ-22 and GТ-23). The allelic constitution of S-RNase gene in each genotype was determined by polymerase chain reaction (PCR) with consensus and allele-specific primers. Eight alleles (S1, S2, S3, S4, S5, S6, S9 and S13) that generated seven S-genotypes [S1S2 (GТ-18), S1S4 (GТ-20 and GТ-22), S3S5 (GТ-3), S3S6 (GТ-21), S3S9 (GТ-17), S4S5 (GТ-23) and S4S13 (GТ-19)] were detected. Among the revealed alleles, S4 was the most frequent (25%), followed by S1 and S3 (18.75% to each allele). Based on the S-allelic constitution, the indigenous sweet cherry genotypes were assigned to the following incompatibility groups: I, V, VI, VII, IX, XVI and XLV. The obtained results represent crucial information on cross-compatibility of these Serbian accessions that is very important for both cherry breeders and growers., Черешата е самостерилен овощен вид с гаметофитна система за несъвместимост (GSI), която се определя генетично от полиморфен локус (S), кодиращ поне два свързани гена, които определят фенотипите на плодника и полените. Следователно повечето генотипове на череша са самонесъвместими и много от тях са кръстосано несъвместими. Целта на настоящия труд бе да се определят S-алелните конституции и групите за несъвместимост в осем местни генотипове на череша, събрани в овощни градини на отделни производители в района на Чачак, т.е. селата Йездина (GТ-3), Прислоница (GТ-17, GТ -18, GТ-19, GТ-20 и GТ-21) и Любич (GТ-22 и GТ-23). Алелната конституция на ген S-RNase във всеки генотип се определя чрез полимеразна верижна реакция (PCR) с консенсус и специфични за алела праймери. Открити са осем алела (S1, S2, S3, S4, S5, S6, S9 и S13), които създават седем S-генотипа [S1S2 (GТ-18), S1S4 (GТ-20 и GТ-22), S3S5 (GТ-3), S3S6 (GТ-21), S3S9 (GТ-17), S4S5 (GТ-23) и S4S13 (GТ-19)]. Сред разкритите алели, S4 енай-често срещания (25%), следван от S1 и S3 (18.75% за всеки алел). Въз основа на S-алелните конституции, местните черешови сортове са разпределени в следните групи на несъвместимост: I, V, VI, VII, IX, XVI и XLV. Получените резултати представляват важна информация за кръстосаната съвместимост на тези сръбски образци, която е много важна както за селекционерите на череши, така и за производителите.", publisher = "Troyan : Research Institute of Mountain Stockbreeding and Agriculture", journal = "Journal of Mountain Agriculture on the Balkans", title = "Determining S-allelic constitution and incompatibility group in some indigenous sweet cherry genotypes grown in West Serbia region, Определяне на S-алелна конституция и група за несъвместимост в някои местни генотипове череши отглеждани в Западна Сърбия", pages = "400-382", number = "6", volume = "24" }
Marić, S., Radičević, S., Milošević, N., Glišić, I.,& Đorđević, M.. (2021). Determining S-allelic constitution and incompatibility group in some indigenous sweet cherry genotypes grown in West Serbia region. in Journal of Mountain Agriculture on the Balkans Troyan : Research Institute of Mountain Stockbreeding and Agriculture., 24(6), 382-400.
Marić S, Radičević S, Milošević N, Glišić I, Đorđević M. Determining S-allelic constitution and incompatibility group in some indigenous sweet cherry genotypes grown in West Serbia region. in Journal of Mountain Agriculture on the Balkans. 2021;24(6):382-400..
Marić, Slađana, Radičević, Sanja, Milošević, Nebojša, Glišić, Ivana, Đorđević, Milena, "Determining S-allelic constitution and incompatibility group in some indigenous sweet cherry genotypes grown in West Serbia region" in Journal of Mountain Agriculture on the Balkans, 24, no. 6 (2021):382-400.